本周四晚20:00，与深圳湾实验室周耀旗、北京大学前沿交叉学科研究院裴剑锋深度探讨AlphaFold 3的创新和趋势！

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5月8日，谷歌DeepMind AlphaFold团队联合Isomorphic Labs公司推出了全新AlphaFold 3，迅速引爆生物界。它拥有全世界最强大的分子预测能力。不仅能预测所有蛋白质结构，还能预测出蛋白质与DNA、RNA、与抗体、与小分子的相互作用。也就是说所有生命过程中涉及的所有分子类型全囊括了。

梳理发展脉络，2018年，AlphaFold在CASP13上横空出世，两年后，DeepMind发布AlphaFold 2，在解决预测评估蛋白质结构难题上迈出一大步，施一公曾评价为：人类在 21 世纪取得的最重要的科学突破之一。不久前推出的AlphaFold 3在此基础上取得进一步突破，预测范围远远超越了蛋白质，能够对包括核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物进行联合结构预测。在预测蛋白质与配体的结合以及抗体与其目标蛋白质的结合方面，准确性有一定的提高。目前，Isomorphic Labs已经开始与制药公司合作，将AlphaFold 3应用于药物设计。

不过有业内人士指出，AlphaFold 3相比于AlphaFold 2，虽然在算法改变不小，但精确度变化不大，也反映出蛋白质结构预测到了一个瓶颈。另外，AlphaFold的结构预测是不是已经能够进行全新药物分子的发现，还有不少争议。虽然AlphaFold 3能够预测一些已知小分子配体的蛋白复合结构，并不一定表明它能够区分有蛋白质功能抑制能力的和没有抑制能力的分子，很明显大多数预测结构的精确度还不够。更重要的是，它不能够准确预测相互作用亲和力。

目前AlphaFold 3服务器每天每人能跑十个任务，没有开源代码，2024年底可能开源，之后应该会有更详细的测评。之前AlphaFold 2问世之后，全球跟进出现了许多端到端的预测平台，包括RoseTTAFold，RGN2，OmegaFold, ESMFold等。主要围绕着改进进化信息的提取，特别是蛋白质语言模型的使用，可以对那些没有太多天然同源序列的蛋白质结构预测进行改进。这些平台大多是开源的。而谷歌将这个版本的AlphaFold专门供给了旗下的Isomorphic Labs。2024年1月，Isomorphic Labs宣布和诺华以及礼来两家药企合作，其项目价值可达30亿美元，这可能意味着大药企认可了AlphaFold 3的能力。

2015年后，海外大型药企和AI制药公司合作项目越来越多，到2018年一路增长至133起，较2014年增长了15倍。但直到今天，全球有80多个进入临床的AI制药项目，却还没有一款AI设计的药物上市。AlphaFold 3的出现是否会改变这一现状呢？

将AI技术的成果转化为实际的医疗解决方案是一个长期的过程。AlphaFold 3未来潜力到底有多大，后续会有哪些进展？对行业有怎样的具体影响？5月23日，本周四晚20:00，热爱创新的嘉程资本开启嘉程创业流水席第218席！我们邀请了深圳湾实验室资深研究员周耀旗、北京大学前沿交叉学科研究院研究员裴剑锋，一起深度探讨AlphaFold 3的创新和趋势！欢迎各位生物、人工智能领域上下游的从业者、创业者、投资人和行业专家一起参加！

再次邀请上车！

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